Pada 5 Desember 2007 memperoleh penghargaan Lifetime Achievement Award dari BRI karena dinilai berjasa dan memberikan sumbangsih di bidang pers.
Selanjutnya, Jakob Oetama memperoleh penghargaan Lifetime Achievement Award dari Persatuan Wartawan Indonesia (PWI) pada 9 Februari 2008. PWI kembali memberikan penghargaan Number One Press Card pada 9 Februari 2010. Penghargaan untuk wartawan terbaik diserahkan oleh Ketua Umum PWI Margiono pada puncak acara Hari Pers Nasional (HPN) 2010 di Palembang.
Pada 24 Maret 2010 memperoleh Bintang Jasa The Order of The Rising Sun dan Gold Rays with Neck Ribbon dari Pemerintah Jepang. Jakob Oetama berjasa dalam meningkatkan hubungan antara negara Jepang dan Indonesia. Penghargaan diberikan oleh Duta Besar Jepang Kojiro Shiojiri di Jakarta.
Pada 18 Agustus 2010 mendapatkan penghargaan Soegeng Sarjadi Award on Lifetime Achievement. Jakob Oetama memiliki peran dan integritas kewartawanannya dalam memperjuangkan kebebasan pers dan demokratisasi di Indonesia.
Penghargaan itu diserahkan dalam perayaan Hari Konstitusi ke-65 dan perayaan satu tahun Soegeng Sarjadi School of Government di Jakarta. Penghargaan diterima wartawan senior August Parengkuan, mewakili Jakob Oetama.
Pada 19 April 2011 memperoleh Medali Emas Spirit Jurnalisme dari Komunitas Hari Pers Nasional 2011. Keberhasilan dalam membangkitkan semangat jurnalisme dalam memajukan karya jurnalistik, dunia pendidikan, dan manajemen pers sehingga pantas menjadi contoh dan teladan bagi insan pers lain. Penghargaan diserahkan oleh Ketua Umum PWI, Margiono di Jakarta.





Komentar tentang post